Новосибирские генетики создают гибрид генома и «цифры»

По мнению генетиков, эта работа должна стать одним из основных направлений развития научной отрасли на федеральном уровне.
  • 19/09/2019, 19:11
Автор: Евгения Серёгина
«Прогноз 2015 года, что к 2025 году суммарный объем генома информации превысит объем данных, накопленных в астрономии, дал недооценку».

Ученые Института цитологии и генетики СО РАН (ИЦиГ) совместно с коллегами из других регионов решают задачу по использованию цифровых технологий для получения генной информации. Об этом новосибирские генетики рассказали на стратегической сессии «Биоинформатика» в рамках форума «Технопром-2019». По мнению ученых, такой симбиоз информатики и биологии позволит решить как фундаментальные, так и прикладные задачи отрасли.

 Генетика стала источником огромных данных,  говорит научный руководитель института, академик Николай Колчанов.  Был прогноз 2015 года, что к 2025 году суммарный объем генома информации в несколько раз превысит объем данных, накопленных в астрономии. Но прогноз оказался не нацеленным на темпы роста генетической информации. Один институт продуцирует около 7 килобайт информации, что соответствует 200 геномам человека. А таких институтов несколько. То есть темпы роста генома информации можем помножить на 4-5. Прогноз давал существенную недооценку.

Новосибирские научные центры примут участие в создании геномных центров

В настоящее время, по данным академика, в институте разрабатывается система, которая интегрирует информацию о 2 млн генов белков, десятках тысяч заболеваний и множестве других молекулярно-генетических характеристик.

 Сейчас разрабатывается компьютерная инженерия знаний, математическое извлечение информации из источников,  говорит Колчанов.  Еще есть статистика геномных проектов. Занимается секвенированием и компьютерной аннотацией только небольшая часть этих проектов. Высокотехнологичные методы имеются, а лидирует глубина и скорость обработки больших генетических данных. Здесь применяются методы машинного обучения искусственного интеллекта, методы нейронного обучения для решения задач распознавания сайтов связывания регуляторных белков, предсказания активности белков и другие.

Как считают генетики, именно биоинформатика в период повсеместного внедрения «цифры» должна стать одним из основных, если не самым основным, в работе нового Центра геномных исследований мирового уровня.

Центр генетических технологий — флагман ННЦ

 Особая актуальность в развитии биоинформатики подтверждается решениями на государственном уровне по созданию генетических центров, центров цифровой экономики, цифровыми приложениями типа «Умное сельское хозяйство», «Цифровая медицина» и так далее,  говорит советник директора института Юрий Зыбарев.  Сегодня нужно переходить к формированию цифровой платформы «Биоинформатика» и создавать вокруг нее соответствующие цифровые экосистемы как некоторые современные тренды. Такие платформы сопровождаются развитыми системами поддержки, подготовки специалистов соответствующих отраслей. Создание платформы для биоинформатики и на ее основе тематически ориентированной «цифры» должно стать одним из основных направлений деятельности Центра генетических технологий.

Сегодня ИЦиГ СО РАН ведет работы совместно с Курчатовским геномным центром. Исследования связаны с молекулярной генетикой, с клеточной биологией, с физиологической генетикой, генетикой человека, генетикой растения. При этом подавляющая часть исследований и научных публикаций по направлению «Генетические технологии для развития сельского хозяйства» идут от ученых ИЦиГ СО РАН.

АФК «Система» и ИЦиГ СО РАН подписали соглашение о сотрудничестве

 Наши задачи  новые генетические линии будущих сортов растений и для производства продовольствия, и для технической промышленности и новые генетические технологии как таковые,  говорит директор ИЦиГ Алексей Кочетов.  Это генетический инструментарий, линии стратегических сельхозкультур (пшеница, рожь, ячмень и так далее) и микробные продуценты незаменимых амминокислот. По результатам 2018 года в составе международного консорциума происходило секвенирование генома пшеницы, комплексные большие проекты освоения технологий геномоадаптирования к получению первых сортов отредактированного ячменя (точнее, не сортов, а лабораторных линий — у нас в стране это пока не разрешено). Несколько сортов введены в оборот в Российской Федерации.

Другим направлением работы ученых ИЦиГ в рамках «Курчатовского центра» является выведение технических культур.

 Это культуры для целлюлозно-бумажной, для химической промышленности. Активно обсуждаются проекты по применению сортов, полученных в ИЦиГ,  говорит директор института.

Напомним, что в рамках реализации национального проекта «Наука» к 2024 году планируется создать 16 научных центров мирового уровня, в том числе не менее 3 центров геномных исследований мирового уровня. Объем финансового обеспечения создания и поддержки центров геномных исследований на период 2019-2024 годов из федерального бюджета составит 11,2 млрд рублей, из них 1,3 млрд — в 2019 году. Один из таких центров планируется создать в Новосибирской области.

Фото: фотобанк форума Технопром

Популярное с сайта

Тему активного долголетия обсудят на форуме OpenBio

Тему активного долголетия обсудят на форуме OpenBio

В нем примут участие более 800 человек из 13 стран.
Регоператор не платит, перевозчики политизируют?

Регоператор не платит, перевозчики политизируют?

Во взаимоотношениях ООО «Экология-Новосибирск» с операторами-перевозчиками начал разбираться федеральный отраслевой регулятор.
С 1 ноября 2019 года электронной сертификации подлежат все готовые молочные продукты

С 1 ноября 2019 года электронной сертификации подлежат все готовые молочные продукты

В минсельхозе региона обсудили готовность предприятий АПК к изменениям в законодательстве.

Подписаться на новости

Введите свой e-mail

 
×
×
Октябрь 2019
Пн Вт Ср Чт Пт Сб Вс
« Сен    
 123456
78910111213
14151617181920
21222324252627
28293031  
×
Arrow
Arrow
Slider
×
Arrow
Arrow
Slider
×
Arrow
Arrow
Slider
×





Отправляя сообщение, я принимаю условия соглашения об использовании персональных данных и соглашаюсь с Правилами сайта
Я согласен (согласна)

×

Оставьте свои контакты и наш менеджер свяжется с вами, чтобы уточнить необходимые данные.



Отправляя сообщение, я принимаю условия соглашения об использовании персональных данных и соглашаюсь с Правилами сайта
Я согласен (согласна)

×

Оставьте свои контакты и наш менеджер свяжется с вами, чтобы уточнить необходимые данные.



Отправляя сообщение, я принимаю условия соглашения об использовании персональных данных и соглашаюсь с Правилами сайта
Я согласен (согласна)

×
Наверх в Новости Новосибирска